На странице редактирования конкретного подключения к почте на вкладке "Выбор папок" можно отметить папки для обработки писем. По умолчанию обрабатываются только папки, названия которых начинаются с "INBOX" и "Входящие".

Если у Вас не отображается часть папок (например, в списке нет недавно созданной папки), нажмите на кнопку "Обновить список папок".